Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpraP18052 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpraP18052 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpraP18052 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpraP18052 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpraP18052 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtpraP18052 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtpraP18052 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpraP18052 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpraP18052 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpraP18052 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtpraP18052 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtpraP18052 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms