Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spi1P17433 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spi1P17433 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spi1P17433 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spi1P17433 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spi1P17433 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms