Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vpreb1P13372 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms