Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcp1P11983 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcp1P11983 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcp1P11983 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms