Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fgf4P11403 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf4P11403 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms