Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prf1P10820 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prf1P10820 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prf1P10820 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prf1P10820 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prf1P10820 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms