Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Amd1P0DMN7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.6 ms