Protein–RNA interactions for Protein: P0CB42

Alkbh1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh1P0CB42 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh1P0CB42 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh1P0CB42 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh1P0CB42 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh1P0CB42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms