Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcrg-V1P06325 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcrg-V1P06325 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcrg-V1P06325 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms