Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01794 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01794 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01794 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01794 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01794 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01794 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01794 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01794 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01794 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01794 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01794 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01794 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P01794 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01794 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01794 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01794 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01794 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01794 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01794 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01794 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01794 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01794 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01794 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01794 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01794 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01794 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01794 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.4 ms