Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pias1O88907 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pias1O88907 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pias1O88907 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pias1O88907 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms