Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp2O88623 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp2O88623 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp2O88623 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp2O88623 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp2O88623 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp2O88623 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms