Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ComtO88587 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ComtO88587 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ComtO88587 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ComtO88587 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ComtO88587 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ComtO88587 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ComtO88587 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ComtO88587 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ComtO88587 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ComtO88587 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ComtO88587 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ComtO88587 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ComtO88587 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ComtO88587 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ComtO88587 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ComtO88587 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ComtO88587 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ComtO88587 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ComtO88587 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ComtO88587 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ComtO88587 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ComtO88587 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ComtO88587 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ComtO88587 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ComtO88587 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ComtO88587 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ComtO88587 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ComtO88587 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ComtO88587 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ComtO88587 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ComtO88587 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ComtO88587 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ComtO88587 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ComtO88587 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ComtO88587 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ComtO88587 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms