Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dnmt3bO88509 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dnmt3bO88509 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dnmt3bO88509 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dnmt3bO88509 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms