Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf106O88466 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf106O88466 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf106O88466 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf106O88466 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf106O88466 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf106O88466 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znf106O88466 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znf106O88466 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znf106O88466 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms