Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syngr1O55100 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syngr1O55100 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syngr1O55100 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syngr1O55100 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr1O55100 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr1O55100 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr1O55100 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syngr1O55100 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syngr1O55100 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syngr1O55100 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syngr1O55100 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syngr1O55100 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr1O55100 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr1O55100 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syngr1O55100 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syngr1O55100 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syngr1O55100 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.2 ms