Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SlkO54988 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SlkO54988 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SlkO54988 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SlkO54988 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SlkO54988 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SlkO54988 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SlkO54988 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SlkO54988 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SlkO54988 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlkO54988 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlkO54988 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlkO54988 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlkO54988 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SlkO54988 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SlkO54988 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SlkO54988 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SlkO54988 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SlkO54988 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SlkO54988 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SlkO54988 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SlkO54988 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SlkO54988 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SlkO54988 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SlkO54988 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SlkO54988 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SlkO54988 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SlkO54988 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SlkO54988 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SlkO54988 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SlkO54988 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SlkO54988 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SlkO54988 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SlkO54988 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SlkO54988 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SlkO54988 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SlkO54988 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SlkO54988 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SlkO54988 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SlkO54988 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SlkO54988 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SlkO54988 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SlkO54988 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SlkO54988 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SlkO54988 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SlkO54988 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SlkO54988 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SlkO54988 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SlkO54988 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SlkO54988 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SlkO54988 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SlkO54988 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SlkO54988 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SlkO54988 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SlkO54988 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SlkO54988 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SlkO54988 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms