Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f6O54917 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2f6O54917 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f6O54917 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2f6O54917 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f6O54917 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2f6O54917 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms