Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Timm44O35857 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Timm44O35857 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Timm44O35857 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Timm44O35857 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Timm44O35857 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Timm44O35857 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 901.2 ms