Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scarb2O35114 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Scarb2O35114 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scarb2O35114 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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