Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rundc3aO08576 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rundc3aO08576 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rundc3aO08576 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms