Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec22bO08547 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec22bO08547 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sec22bO08547 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms