Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IfnabL7MTU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IfnabL7MTU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms