Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4312K9J7E2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm4312K9J7E2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4312K9J7E2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4312K9J7E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms