Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21798J3QNU5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm21798J3QNU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm21798J3QNU5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21798J3QNU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21798J3QNU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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