Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mfsd4b4J3QNS5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms