Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm21976J3QNN2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Gm21976J3QNN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21976J3QNN2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Gm21976J3QNN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Gm21976J3QNN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Gm21976J3QNN2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21976J3QNN2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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