Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Calhm3J3QMI4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calhm3J3QMI4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Calhm3J3QMI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Calhm3J3QMI4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms