Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28051J3QMA2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28051J3QMA2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms