Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930544D05RikJ3QK56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930544D05RikJ3QK56 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930544D05RikJ3QK56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms