Protein–RNA interactions for Protein: J3QK27

Gm21693, Predicted gene, 21693, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21693J3QK27 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21693J3QK27 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21693J3QK27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21693J3QK27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms