Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pot1bH7BX60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pot1bH7BX60 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms