Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5218F6YH22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm5218F6YH22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5218F6YH22 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms