Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igkv1-99F6XWB2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Igkv1-99F6XWB2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Igkv1-99F6XWB2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Igkv1-99F6XWB2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Igkv1-99F6XWB2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms