Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gm21977F6U3N7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21977F6U3N7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms