Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8M1

Zfp358, Zinc finger protein 358, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp358E9Q8M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp358E9Q8M1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp358E9Q8M1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp358E9Q8M1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp358E9Q8M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfp358E9Q8M1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms