Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Arhgef5E9Q7D5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Arhgef5E9Q7D5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Arhgef5E9Q7D5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Arhgef5E9Q7D5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Arhgef5E9Q7D5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Arhgef5E9Q7D5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms