Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r238E9Q373 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r238E9Q373 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms