Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt90E9Q1Z0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt90E9Q1Z0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt90E9Q1Z0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms