Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrp3E9Q1T6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrp3E9Q1T6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrp3E9Q1T6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms