Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp558E9Q1J0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp558E9Q1J0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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Zfp558E9Q1J0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp558E9Q1J0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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