Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prrt2E9PUL5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrt2E9PUL5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prrt2E9PUL5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms