Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mterf1bB9EJ57 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mterf1bB9EJ57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms