Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Phf11bB4XVQ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phf11bB4XVQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms