Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba1B2RUJ5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba1B2RUJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apba1B2RUJ5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms