Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud4B2RRE7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otud4B2RRE7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms