Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Upf2A2AT37 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Upf2A2AT37 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Upf2A2AT37 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms