Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc183A2AJB1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms