Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm13941A2AJ38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm13941A2AJ38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm13941A2AJ38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm13941A2AJ38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms