Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VirmaA2AIV2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VirmaA2AIV2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VirmaA2AIV2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VirmaA2AIV2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms